德川幕府末期，来自外太空的天人降临，江户完全处于他们的统治之下。在此之后，天人文明高度发达，高楼大厦拔地而起，电车电话遍布大街小巷。在这座现代化都市的一隅，平素里懒洋洋但骨子里仍秉持着武士之魂的坂田银时（杉田智和 配音）经营着一家接受客人各种委托的万事屋。在存在感稀薄的志村新八（阪口大助 配音）和夜兔族幸存者神乐（钉宫理惠 配音）围绕下，万事屋度过繁忙而又麻烦多多的每一天。 　某次意外事件，银时被抛入时空隧道出现在五年后的世界。呈现在他眼前的，是被神秘病毒“白色诅咒”饱经摧残已成废墟的江户。百姓贫困痛苦，攘夷志士策划向政府发动绝死反攻，社会秩序全面崩溃。在此期间，彷徨无助的银时邂逅了两个年轻人，一个是腰别洞爷湖英姿飒爽的眼镜青年，另一个是带着巨大的白狗身着华服的冷艳美女，他们竟然是已经成长起来了新八和神乐！更令银时难以置信的是，他竟亲眼目睹刻有自己名字的墓碑！ 　　过去五年究竟发生了什么？如何才能改变这个没有银时、遍布黑暗与恐怖的未来？